"Astratto
"Abbiamo identificato l'RNA della sindrome respiratoria acuta grave del coronavirus 2 in un campione di tampone orofaringeo raccolto da un bambino con sospetto di morbillo all'inizio di dicembre 2019, circa 3 mesi prima del primo caso di malattia da coronavirus identificato in Italia. Questa scoperta amplia la nostra conoscenza sui tempi e la mappatura di nuove vie di trasmissione del coronavirus.---
Studi filogenetici hanno evidenziato una precoce circolazione di SARS-CoV-2 in Italia e suggeriscono molteplici introduzioni del virus dalla Cina e dalla Germania, seguite da una trasmissione autoctona (4,5). Inoltre, la sorveglianza ambientale ha inequivocabilmente dimostrato la presenza del virus, a concentrazioni paragonabili a quelle ottenute da campioni raccolti nelle fasi successive della pandemia, nelle acque reflue non trattate dell'area milanese già a metà dicembre 2019 (6).
"Come partecipanti alla Rete italiana per il morbillo e la rosolia, un sistema di sorveglianza basato sui casi sensibili, abbiamo osservato a Milano durante la fine dell'autunno 2019 casi di sospetto morbillo in pazienti che alla fine sono risultati negativi al morbillo. Abbiamo quindi esplorato retrospettivamente un possibile coinvolgimento eziologico della SARS- CoV-2 in questi casi di eruzione cutanea non legati al morbillo.
e MaSi Ar 5'-ACACTGACACCACCAAAAGAAC-3 '. Anche i controlli positivi e negativi sono stati inclusi in ciascun test PCR ed eseguiti come previsto.
"Un campione di tampone orofaringeo è risultato positivo. L'amplicone è stato sequenziato utilizzando la tecnologia Sanger, ottenendo una sequenza di 409 bp. Analisi della sequenza eseguita utilizzando BLAST ( https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) hanno mostrato il 100% di identità alla sequenza di riferimento Wuhan-HU-1 (accesso GenBank n. NC_045512.2) nonché a sequenze di altri ceppi di SARS-CoV-2 circolanti in tutto il mondo in una fase successiva; pertanto, non è stato possibile determinare con precisione l'origine del ceppo identificato. Il campione è stato confermato come positivo mediante ripetute amplificazioni e sequenziamento e tutti gli altri campioni sono stati ripetutamente negativi. La sequenza (SARS-CoV-2_Milan_Dec2019 [GenBank accession no. MW303957]) è stata identificata in un campione raccolto da un bambino di 4 anni che viveva nei dintorni di Milano e non aveva precedenti di viaggio segnalati. Il 21 novembre 2019 il bambino ha avuto tosse e rinite; circa una settimana dopo (30 novembre 2019), è stato portato al pronto soccorso con sintomi respiratori e vomito. Il 1 ° dicembre 2019 ha avuto inizio di un'eruzione cutanea simile al morbillo; il 5 dicembre 2019 (14 giorni dopo l'insorgenza dei sintomi), il campione di tampone orofaringeo è stato ottenuto per la diagnosi clinica di sospetto di morbillo. Il decorso clinico di questo paziente, che includeva manifestazioni cutanee tardive, assomiglia a quanto riportato da altri autori; le lesioni maculopapulari sono state tra le manifestazioni cutanee più diffuse osservate durante la pandemia COVID-19, e diversi studi hanno notato un esordio successivo nei pazienti più giovani (7).
non era ottimale per il rilevamento di SARS-CoV-2 perché era un campione di tampone orofaringeo piuttosto che rinofaringeo ed è stato raccolto 14 giorni dopo la comparsa dei sintomi, quando la diffusione virale è ridotta. Inoltre, lo scongelamento potrebbe aver parzialmente degradato l'RNA, impedendo il sequenziamento di regioni genomiche più lunghe che avrebbero potuto essere utili per determinare l'origine del ceppo.
"Questa scoperta è di importanza epidemiologica perché amplia la nostra conoscenza sui tempi e sulla mappatura delle vie di trasmissione della SARS-CoV-2. La diffusione a lungo termine e non riconosciuta della SARS-CoV-2 nel nord Italia aiuterebbe a spiegare, almeno in parte, l'impatto devastante e il rapido decorso della 1 ° ondata di COVID-19 in Lombardia. Il pieno sfruttamento dei sistemi di sorveglianza virologica esistenti per identificare tempestivamente i patogeni emergenti è quindi una priorità per chiarire più precisamente l'andamento dei focolai in una popolazione. Ulteriori studi finalizzati alla rilevazione L'RNA di SARS-CoV-2 in campioni archiviati adatti al sequenziamento dell'intero genoma sarà cruciale per determinare esattamente la tempistica dell'epidemia di COVID-19 in Italia e sarà utile per la preparazione contro future epidemie ".
Ora ci sono prove crescenti che il virus stava circolando al di fuori della Cina prima di essere ufficialmente riconosciuto. La prima identificazione è stata un caso in Francia nel dicembre 2019 (vedere aggiornamento COVID-19 (160): globale, caso Francia dicembre 2019, tocilizumab, OMS, RFI 20200506.7304287e rif. 1 sotto). Gli Stati Uniti hanno recentemente pubblicato su possibili prove di circolazione del virus negli Stati Uniti prima del 20 gennaio 2020, il 1 ° caso confermato. Basavaraju et al. (rif. 2 di seguito) hanno utilizzato sieri della banca del sangue e sierologia testata: "Dei 7389 campioni, 106 erano reattivi per pan Ig. Di questi 106 campioni, 90 erano disponibili per ulteriori test. Ottantaquattro su 90 avevano attività neutralizzante, 1 aveva Attività di legame S1 e 1 aveva un'attività di blocco del dominio di legame del recettore / Ace2 maggiore del 50%, suggerendo la presenza di anticorpi reattivi anti-SARS-CoV-2. Donazioni con reattività si sono verificate in tutti i 9 stati. " Anche altri studi sulle acque reflue hanno suggerito la presenza del virus. (Aggiornamento COVID-19 (272): acque reflue in Italia, macello in Germania, OMS, globale 20200620.7490347e rif. 3 e 4 sotto). Siamo chiaramente ancora sulla pendenza ascendente della curva di apprendimento rispetto al SARS-CoV-2.
Riferimenti
1. Deslandes A, Berti V, Tandjaoui-Lambotte Y, et al. SARS-CoV-2 si stava già diffondendo in Francia alla fine di dicembre 2019. Int J Antimicrob Agents. 2020; 55 (6): 106006. https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2020.106006
2. Basavaraju SV, Patton ME, Grimm K, et al. Test sierologici delle donazioni di sangue degli Stati Uniti per identificare gli anticorpi reattivi alla SARS-CoV-2: dicembre 2019-gennaio 2020. Clin Infect Dis. 2020; ciaa1785. https://doi.org/10.1093/cid/ciaa1785
3. La Rosa G, Mancini P, Bonanno Ferraro G, et al. SARS-CoV-2 circola nel nord Italia da dicembre 2019: prove dal monitoraggio ambientale. Sci Total Environ. 2021; 750: 141711. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.141711
4. La Rosa G, Iaconelli M, Mancini P, et al. Primo rilevamento di SARS-CoV-2 in acque reflue non trattate in Italia. Sci Total Environ. 2020; 736: 139652. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.139652
- Mod.MPP]
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