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martedì 7 agosto 2012

NEW ENDEMIC WEST NILE VIRUS LINEAGE 1A IN NORTHERN ITALY, JULY 2012- West Nile virus - Eurasia (03): Italia

 
Inviato da: tyuill
5 agosto -
West Nile Virus, Italia, gli Umani
Riportiamo qui la prima donazione di sangue positivo per il virus West Nile (WNV) mediante test di amplificazione dell'acido nucleico raccolti nel nord-est d'Italia nel mese di luglio 2012.Sequenziamento parziale del WNV RNA dimostrato identità con un WNV lignaggio 1a genoma individuato nella stessa zona nel 2011 e divergenza dal ceppo responsabile del focolaio nel nord Italia nel 2008-09. Questi dati indicano che l'attività WNV nel nord Italia sta avvenendo prima del previsto e che i differenti ceppi WNV
Traduzione google traduttore
 
Eurosurveillance, Volume 17, Numero 31, 2 agosto 2012
Comunicazioni rapide
NEW ENDEMICA VIRUS DEL NILO OCCIDENTALE LIGNAGGIO 1A NEL NORD ITALIA, LUGLIO 2012
L Barzon 1 , 2 , M Pacenti 2 , E Franchin 1 , 2 , E Lavezzo 1 , T Martello 2 , L Squarzon 1 , S Toppo 1 , F Fiorin 3 , G Marchiori 3 , F Russo 4 , M Cattai 2 , R Cusinato 2 , G Palù ( ) 1 , 2
  1. Dipartimento di Medicina Molecolare, Università degli Studi di Padova, Padova, Italia
  2. Laboratorio di Riferimento Regionale per le Malattie Infettive, Unità Microbiologia e Virologia, Università di Padova Ospedale, Padova, Italia
  3. Dipartimento di Medicina Trasfusionale, Area veneta, Venezia, Italia
  4. Dipartimento di Sanità Pubblica e Screening, Regione Veneto, Venezia, Italia
Stile di citazione per questo articolo: Barzon L, M Pacenti, Franchin E, Lavezzo E, Martello T, Squarzon L, S Toppo, Fiorin F, Marchiori G, Russo F, Cattai M, R Cusinato, Palù G. endemica New West Nile virus lignaggio 1a nel nord Italia, luglio 2012. Euro Surveill. 2012; 17 (31): pii = 20231. Disponibile online: http://www.eurosurveillance.org/ViewArticle.aspx?ArticleId=20231Data di presentazione: 26 Luglio 2012
Riportiamo qui la prima donazione di sangue positivo per il virus West Nile (WNV) mediante test di amplificazione dell'acido nucleico raccolti nel nord-est d'Italia nel mese di luglio 2012. Sequenziamento parziale del WNV RNA dimostrato identità con un WNV lignaggio 1a genoma individuato nella stessa zona nel 2011 e divergenza dal ceppo responsabile del focolaio nel nord Italia nel 2008-09. Questi dati indicano che l'attività WNV nel nord Italia sta avvenendo prima del previsto e che i diversi ceppi di WNV circolante.
Come parte dello screening delle donazioni di sangue, tessuti, e organo, eseguita in Italia secondo il piano nazionale nel periodo tra il 15 luglio e il 30 novembre, West Nile virus (WNV) è stato rilevato dal test di amplificazione dell'acido nucleico (incidenza sensibile sul commercio) in un donazione di sangue il 15 luglio 2012. NAAT è stato eseguito presso il Dipartimento di Medicina Trasfusionale in Provincia di Venezia con il sistema automatizzato Procleix TIGRIS (Novartis Vaccines and Diagnostics, Inc., Emeryville, CA, USA). Al momento della donazione del donatore WNV-positivo è asintomatica ed è rimasto asintomatico durante il follow-up. Il Laboratorio Regionale di Riferimento ha dimostrato una bassa carica virale nel plasma mediante real-time RT-PCR quantitativa (circa 1.000 equivalenti genoma / mL) e l'assenza di WNV IgM ed IgG, al momento della donazione (testato da DxSelect Capture WNV IgM e IgG WNV DxSelect ; messa a fuoco Diagnostics Inc., Cypress, CA, USA). Due giorni dopo la donazione, freschi campioni di sangue e urine sono stati prelevati dal donatore e testati dal laboratorio di riferimento regionale con il Cobas TaqScreen test Virus del Nilo occidentale (Roche, Basel, Svizzera) e due diverse real-time RT-PCR metodi, come riferito [1]. In questi campioni, RNA WNV è stata dimostrata nel siero e plasma, ma non nelle urine, e la presenza di IgM WNV nel siero. Follow-up test nove giorni dopo la donazione ha dimostrato che il plasma, leucociti, e campioni di urina sono stati WNV-RNA negativo. Purtroppo, l'isolamento del virus in coltura cellulare non ha avuto successo.

Epidemiologia del West Nile virus in Italia

WNV è emerso negli ultimi anni in Europa centrale, orientale ei paesi mediterranei, e le epidemie in queste aree sono diventate sempre più frequenti [2]. In Italia, il virus è stato identificato nei cavalli nel 1998 in Toscana, ma non casi umani sono stati identificati al momento [3]. I primi casi umani di malattia di WNV sono stati identificati nel 2008, nelle regioni italiane nord-orientali che circondano il delta del Po [4,5]. In queste aree, nel 2008 e 2009, diversi casi umani di malattia WNV sono stati identificati, si sono verificati focolai di grandi dimensioni tra i cavalli, e la circolazione diffusa WNV è stato dimostrato da screening di uccelli e zanzare [6,7]. Analisi di sequenza del genoma di ceppi di WNV isolati in Italia nel 2008 e nel 2009 mostrava che erano strettamente correlate [6,8,9], suggerendo che il virus era sopravvivere ed ha stabilito un ciclo endemico in Italia. Province interessati dalla circolazione WNV sono indicati nella Figura 1. Nel 2010, i casi umani di malattia di WNV sono stati segnalati solo in Veneto (Figura 1), dove i programmi speciali di sorveglianza per la febbre West Nile era stata attivata [1,10] la circolazione, e il virus è stato registrato nelle aree più settentrionali rispetto a quelli colpiti in anni precedenti [1]. In due donazioni di sangue dal Veneto nel 2010, la tipizzazione era possibile e lignaggio WNV 1 è stato identificato da specifiche real-time RT-PCR, ma a causa del basso carico virale, sequenziamento del genoma virale non ha avuto successo [1]. Nel 2011, l'attività WNV stato osservato un aumento in Italia, coinvolgendo un territorio più vasto geografica in regioni nord-orientali (Figura 1) così come la Sardegna e le regioni Marche, dove la circolazione WNV non era stato segnalato prima [11].
Figura 1. Province del Nord Italia con casi umani confermati di malattia West Nile neuroinvasive, Italia, 2008-2011

L'analisi filogenetica

WNV RNA è stato amplificato e sequenziato dal plasma del donatore positivo identificato luglio 2012. Frammenti di WNV E (278 nt), NS2B-NS3 (721 nt), e NS5 geni (182 nt) (numero di accesso GenBank JX417422) ha dimostrato identità di sequenza 100% con il WNV genoma Livenza (adesione GenBank n. JQ928174) che era rilevato nel mese di settembre 2011 in un residente sangue del donatore in un villaggio vicino, e completamente sequenziato (Figura 2).Entrambe le sequenze genomiche apparteneva alla stirpe 1a e si riferiscono al WNV ceppi del sottotipo Mediterraneo occidentale.
Figura 2. confronto filogenetico molecolare del ceppo del virus West Nile isolato in Italia nel 2012 con i ceppi

Un ulteriore lignaggio WNV sequenza del genoma 1a, WNV Piave (numeri di accesso GenBank JQ928175), era stata ottenuta nel 2011 da campioni biologici raccolti da un destinatario del trapianto. Tuttavia, i due genomi WNV 2011 aveva un elevato nucleotidica e amminoacidica divergenza di sequenza di acido uno dall'altro e dal ceppo WNV circolante in Italia in 2008-09 (Figura 2).
Discussione

Il WNV-positivo donatore identificato nel luglio 2012 era residente in un villaggio in provincia di Venezia, che si trova nei pressi del fiume Livenza (Figura 1). L'analisi di sequenza di RNA virale dal donatore dimostrato identità di sequenza 100% con un genoma di WNV che è stato completamente sequenziato l'anno prima da un residente sangue del donatore in un villaggio vicino (Figura 2). Questa scoperta suggerisce fortemente svernamento del cosiddetto ceppo Livenza WNV nella zona umida che circonda il fiume Livenza nel nord-est Italia, dove ha probabilmente stabilito un ciclo endemico.
Nel 2012, come negli anni precedenti [1,11], il periodo di sorveglianza per i casi umani di malattia WNV nelle zone colpite in Italia dura dal 15 giugno al 30 novembre, mentre il periodo di amplificazione degli acidi nucleici WNV acido test (incidenza sensibile sul commercio), lo screening del sangue , donazioni di tessuti e organi dura dal 15 luglio al 30 novembre. Poiché la maggior parte dei casi umani di infezione da WNV rilevata in Italia finora sono stati identificati nel mese di settembre, quando l'attività zanzara è più alto, e meno casi nel mese di agosto e ottobre, è stato inaspettato per trovare una incidenza sensibile sul commercio-positivo WNV donazione di sangue, come già il primo giornata di screening del sangue il 15 luglio 2012.
Tale individuazione precoce di un caso umano di infezione durante la stagione 2012 potrebbe prevedere l'aumento dell'attività WNV, che richiede una sorveglianza rafforzata. E 'concepibile che la primavera calda e un'estate molto calda nel nord-est d'Italia può avere WNV favorito diffuse a causa di un aumento della densità di zanzara. Quest'anno, la diagnosi precoce dei casi di malattia di WNV è stata segnalata anche in Sardegna, in Grecia, Israele e Territori palestinesi occupati [14], e questa tendenza potrebbe prevedere un aumento dell'attività virale nel bacino del Mediterraneo.
In conclusione, questo studio riporta un nuovo ceppo WNV endemici rilevati nel nord-est responsabile di un caso umano di infezione all'inizio dell'estate 2012 in Italia. Questo studio indica anche l'importanza dello screening WNV NAAT per la sicurezza del sangue, dei tessuti, e le donazioni di organi.
Finanziamento

Questa ricerca è stata finanziata dalla Regione Veneto, da parte dell'UE (7 ° PQ WINGS progetto, non concede. 261.426), e dall'Università di Padova (concessione n. CPDA108383/10) a Giorgio Palù.

Riferimenti
  1. Barzon L, M Pacenti, Cusinato R, M Cattai, Franchin E, Pagni S, et al. Casi umani di infezione da virus del Nilo occidentale nel nord-est Italia, 15 giugno al 15 novembre 2010. Euro Surveill. 2011; 16 (33): pii = 19949.Disponibile da: http://www.eurosurveillance.org/ViewArticle.aspx?ArticleId=19949
  2. Reiter P. West Nile virus in Europa: capire il presente per valutare il futuro. Euro Surveill. 2010; 15 (10): pii = 19508. Disponibile da: http://www.eurosurveillance.org/ViewArticle.aspx?ArticleId=19508
  3. Autorino GL, Battisti A, Deubel V, Ferrari G, Forletta R, Giovannini A, et al. Epidemia di virus West Nile in cavalli, regione Toscana, Italia. Emerg Infect Dis. 2002; 8 (12) :1372-8.
  4. Rossini G, F Cavrini, Pierro A, Macini P, Finarelli A, Po C, et al. Primo caso umano di infezione da virus West Nile neuroinvasive in Italia, settembre 2008 - caso clinico. Euro Surveill. 2008; 13 (41): pii = 19002. Disponibile da:http://www.eurosurveillance.org/ViewArticle.aspx?ArticleId=19002
  5. L Barzon, Squarzon L, M Cattai, Franchin E, S Pagni, Cusinato R, et al. Infezione da virus West Nile in Veneto, Italia, 2008-2009. Euro Surveill. 2009; 14 (31): pii = 19289. Disponibile da:http://www.eurosurveillance.org/ViewArticle.aspx?ArticleId=19289
  6. L Barzon, Franchin E, Squarzon L, Lavezzo E, S Toppo, Martello T, et al. Analisi di sequenza del primo genoma umano virus West Nile isolati in Italia nel 2009. Euro Surveill. 2009; 14 (44): pii = 19384. Disponibile da:http://www.eurosurveillance.org/ViewArticle.aspx?ArticleId=19384
  7. Rizzo C, Vescio F, Declich S, Finarelli AC, Macini P, Mattivi A, et al. Trasmissione del virus West Nile, con casi umani in Italia, agosto-settembre, 2009. Euro Surveill. 2009; 14 (40): pii = 19353. Disponibile da:http://www.eurosurveillance.org/ViewArticle.aspx?ArticleId=19353
  8. Rossini G, F Carletti, Bordi L, Cavrini F, P Gaibani, Landini MP, et al. L 'analisi filogenetica di isolati del virus del Nilo occidentale, Italia, 2008-2009. Emerg Infect Dis. 2011, 17 (5) :903-6.
  9. E Sotelo, Fernández-Pinero J, Llorente F, Vázquez A, Moreno A, Agüero M, et al. Relazioni filogenetiche di Mediterraneo occidentale ceppi di virus del Nilo occidentale (1996-2010) con full-length sequenze di genoma: le introduzioni singole o multiple? J Gen Virol. 2011; 92 (PT11) :2512-22.
  10. Gobbi F, L Barzon, Capelli G, Angheben A, Pacenti M, Napoletano G, et al. La sorveglianza per West Nile, dengue, e infezioni da virus Chikungunya, Regione Veneto, Italia, 2010. Emerg Infect Dis. 2012; 18 (4) :671-3.
  11. Rizzo C, Salcuni P, Nicoletti L, Ciufolini MG, Russo F, Masala R, et al. Sorveglianza epidemiologica delle malattie del Nilo occidentale neuroinvasive in Italia, 2008 al 2011. Euro Surveill. 2012; 17 (20): pii = 20172.Disponibile da: http://www.eurosurveillance.org/ViewArticle.aspx?ArticleId=20172
  12. Jukes TH, CR Cantor. Evoluzione delle molecole proteiche. In: Munro HN, editor. Le proteine ​​del metabolismo dei mammiferi. New York: Academic Press, 1969. pp 21-132.
  13. Tamura K, D Peterson, Peterson N, Stecher G, Nei M, S. Kumar MEGA5: analisi molecolare Genetica Evoluzionistica con la massima verosimiglianza, la distanza evolutiva, e metodi di massima parsimonia. Mol Biol Evol. 2011; 28 (10) :2731-9.
  14. Centro europeo di prevenzione e controllo delle malattie (ECDC). Febbre del Nilo occidentale mappe.Situazione aggiornamento 26 luglio 2012. Stoccolma: ECDC. [Consultato il 1 ° agosto 2012]. Disponibile da:http://ecdc.europa.eu/en/healthtopics/west_nile_fever/West-Nile-fever-maps/
http://www.eurosurveillance.org/ViewArticle.aspx?ArticleId=20231

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